Мутация это ключ к разгадке тайны эволюции. Путь развития простейшего организма до господствующего вида длится тысячелетиями, но через каждую сотню тысяч лет в эволюции происходит резкий скачок вперёд.

Что есть мутанты? Люди с  более развитым геномом, наделённые необычными способностями. Но, к сожалению, их таланты остались невостребованы обществом. Человек испокон веков страшился всего нового и необъяснимого, того, что не подвластно его уму и сознанию. Наш рассказ начинается с 90-х годов, предвещающих начало нового времени. Молодой, но одарённый парень, получивший степень профессора, решил открыть свою школу для "особенных" детей, гонимых и презираемых в мире "нормальных" людей.  Итак Чарльз Ксавьер и его друг Эрик Леншер совместно ищут молодых мутантов, предлагая им защиту, кров и надежду вписаться в общество.
Поиски были обычным занятием для них до того дня, пока они не наткнулись на девочку, обладающую уникальным даром. Её родители жаловались на то, что она была слишком замкнутой в себе, что для обычного американского подростка было непозволительным грехом. Но только взглянув на нее, Чарльз поразился: он впервые увидел мутанта, достигшего высшей степени эволюции - и это в ее юные года. Никто доселе, из известных Ксавьеру мутантов, не располагал мощью и силой, подвластные сей барышне. Профессор убедил девочку обучаться у него, поставив в подсознание Джин несколько барьеров, которые не давали вырваться всей её силе, ибо опасно было оставлять их без контроля.

На территории США начала действовать неизвестная группа мутантов. Озлобленные непризнанием и травлей со стороны обычных людей, они решают совершить революцию в мире, начав с свержения рода человеческого. Дабы привлечь к себе внимание, они убивают видных мировых политиков, призывая тем самым других, прячущихся в тени и безызвестности, мутантов присоединиться к их мятежу. Однако люди, словно жаждущие крови, начинают открытую охоту на тех, кто отличен от них. Снедаемые паническим ужасом пред лицом неизвестного врага, главы государств обвиняют друг друга в убийствах и сотрудничестве с мутантами, отчего скандал грозит перерасти в Третью мировую войну.
В это время лидер группы мутантов, известный как Иллюзионист, узнаёт о существовании мутанта 5-го уровня, и естественно желает заполучить его способности себе. Назначая вознаграждение среди своей своры, отвественных за начало смуты, миллион долларов тому, кто найдёт и принесёт к нему столь могущественное существо.

Но и это ещё не всё, во всех континентах мира начинают пропадать люди с геном икс в организме. Конечно,  обычного человека не тревожит судьба "иных", но сами мутанты обеспокоены. Некоторые уверены, что пропажи случайны, не больше, чем совпадения Однако ходят слухи, что во всём виноват никому неизвестный отряд, состоящий из  солдат, обладающих тем же геном икс. Они выслеживают и ловят себе подобных, их цели и мотивы остаются для всех загадкой.Правда, поговариваю, что этим отрядом заведует какая-то военная организация,собирающая мутантов, как подопытных крыс, для бесчеловечных экспериментов. Так ли оно - никто не берется судить, но мутанты продолжают бесследно исчезать.

Две сверх державы находятся в военном положении, после тех загадочных убийств деятелей политики. Правительства обеих сторон начинают тыкать пальцем в друг друга, в поисках виноватого. Итак волнение на максимуме, а ракеты готовы в любой момент сорваться с цепи, одарив врага ядерным взрывом. Среди мутантов бушует смута, именно в этот момент.Чарльз Ксавьер решается набрать собственную команду мутантов, он решил взять себе всех кто готов к бою ради того что бы предотвратить войну,и навести мир между братьями мутантами и людьми,показав обоим что все на этой земли равны и имеют равное право на сосуществование.Однако его лучший друг всё больше отклоняется в сторону что ведёт против людей,они уже не доверяют друг другу как раньше.И Чарлз надеется что сможет уберечь своего кровного брата от тьмы.Итак что же будет далее,смогут ли мутанты свергнуть людей или же всё будет наоборот.Начнётся ли война,или же удастся восстановить мир между враждующими Странами.Решать только вам.